造成畸形死胎的主要原因，有以下几方面：

1.染色体结构异常：遗传性的疾病可以引起胚胎基因突变以及染色体异常，导致胎儿畸形或死胎。

2.基因畸变：在妊娠早期，如果胎儿受到了感染或者是孕妇使用了对胎儿有致畸作用的药物，或者是接触到了有毒的物质、放射线等，可以导致胎儿遗传基因突变。从而造成染色体畸形，导致胎儿畸形死亡。

3.胎儿缺氧：大约一半的死胎是因为缺氧导致，比如脐带扭转、胎盘功能异常、脐带打结、胎儿严重畸形如严重先天性心脏病、双胎输血综合症、妊娠合并症以及感染等。