引起消化不良的疾病主要是一些胃肠道方面的疾病，当然，有肝胆方面的疾病，是有可能会导致患者出现消化不良。

临床当中比较常见的有急性胃炎、急性胃肠炎、慢性胃炎、消化性溃疡、溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核、肠道息肉、肠道肿瘤性疾病、肠易激综合征等。

肝胆疾病主要是有胆管梗阻或者是急性胆囊炎、胆结石等疾病，有可能会影响胆汁的分泌时，也会导致患者出现消化不良。一旦患者出现消化不良症状时，需要详细询问患者的既往疾病情况以及最近的饮食情况，可以明确大致的疾病方向。