角膜基质炎有复发的可能。

角膜基质炎的病因较多，而且复杂，与细菌、病毒、寄生虫、梅毒、螺旋体等感染有关，最主要的致病原因还是病毒感染，病毒感染是容易复发的。因此，在治疗上，一定要合理、有效、规范的治疗，在一定程度上，是可以减轻或者消除眼部不适症状，还可以避免角膜瘢痕引起的视力下降。对于病毒侵袭角膜基质层，会出现中央角膜基质盘状水肿，经过治疗后，是很容易反复发作的。

因此，在治疗过程中，是需要足够疗程抗病毒治疗，控制病情的进一步复发。