直肠菜花状腺瘤属于良性的病变，但是活检病理只是针对表浅的组织进行化验的。对于患者必要时可以再次采取活检证实的，但是活检位置需要深一点的。

腺瘤病灶小的情况下，可以采取肠镜下电切手术治疗的。如果病灶比较大的情况下，需要采取直肠部分手术切除的，术后的病理再次证实疾病的性质及严重程度。如果出现癌变的情况，术后必要时再次采取根治性手术治疗，也是可能需要采取化疗治疗的。治疗后需要定期复查，防止复发和转移。