治疗肛周脓肿的手术危险不大。

肛周脓肿的手术方式大多数是切开引流术，较少病例采取分次、多部位分开切开引流。其手术目的主要是切开脓腔，消除脓肿造成周边组织器官的压力，避免脓肿向深部或者其他器官蔓延扩散。充分引流脓液，减少脓液的吸收，清除脓苔和坏死组织，利于肉芽快速生长。

其手术切开的选择点多采用脓肿的最表浅位置，触摸波动感最明显，进入脓腔距离最短的原则。手术医师都会选择避开重要组织、器官作为切入点，所以切开引流术的危险性和损伤其他组织的几率较小。