治疗表皮样囊肿，如果患者症状不明显，可以不治疗。观察时间每半年复查一次，注意是不是患者有癫痫发作，定期检查脑电图。

如果囊肿变大，出现压迫症状，尽快手术治疗，手术切除就可治愈。需要完整切除囊肿，至少把囊肿切开，然后挤出囊肿里面的东西，包括完整的囊壁。如果不这样治疗，残余的囊壁，就有可能再次复发。

还有囊壁可能会继发细菌感染，对继发细菌感染的表皮样囊肿的治疗方案就是最大限度的切开引流内容物，联合使用抗生素治疗，使用曲安西龙有利于消退炎症。