扁桃体发炎的危害主要有以下几点：

1.可能会感染扁桃体周围的器官，因为慢性扁桃体炎和细菌或者病毒感染有关系，如果长期反复发作就会感染其他器官，引起急性中耳炎、急性鼻炎等。

2.可能会引起扁桃体过度肥大，尤其是对于年纪比较小的患者，长期慢性扁桃体炎会导致扁桃体过度肥大，严重的会影响到呼吸、说话和吞咽，此时需要做手术进行切除。

3.慢性扁桃体炎还有可能会导致一些肠胃的反应，比如没有食欲、恶心等症状，因为扁桃体发炎时会分泌脓液进入到肠胃。

4.慢性扁桃体发炎发作时浑身抵抗力都会下降，非常容易出现一些并发症，比如肾炎、风湿性关节炎等。