治疗慢性淋菌性精囊炎主要应该选择抗菌药物，按照疗程选择敏感的抗生素进行抗炎补液对症治疗，所谓的慢性炎症也就是疾病是疾病病程较长，并且容易反复发作迁延不断。

确诊是淋球菌这一种致病菌感染的，临床可以选择第3代的头孢类抗生素或者是大环内酯类的抗生素进行治疗，可以静脉使用头孢曲松钠配合左氧氟沙星注射液进行抗炎处理。

治疗期间尽量避免性行为，避免造成交叉感染。