男性生殖器官畸形，包含的内容比较广泛，单纯依赖B超检查不一定完全能检查出来。比如：有些病人像外生殖器畸形，也是不需要B超检查，单纯医生查体、肉眼观察也能判断出来，比如像一些包茎、尿道下裂、阴茎扭转等疾病，是不需要B超检查的。

但是如果病人出现前列腺发育不全、精囊缺损，B超检查有时是可以发现的。有时候睾丸的畸形做B超也能发现；有些病人有多睾症、隐睾，通过B超检查可以发现。