肛门上长了一颗小疙瘩的原因较多，常见的有以下几种因素：

1.有可能是痔疮导致，比如患有外痔的患者，肛门口处就会形成一个或是多个小肉球。还有患有内痔疮的患者，当痔核脱出后，肛门口处就会有个小疙瘩。

2.患有肛门乳头肥大或是肛乳头瘤、肛门息肉的，会有肛门口处出现肿物的表现。

3.患有肛瘘、肛周脓肿的，也容易出现这样的症状。同时，还会伴有按压痛的现象。

建议出现这种情况时，最好可以去医院的肛肠科就诊，查明病因后，再进行有效治疗。