喝柠檬水对预防和辅助治疗肾结石有一定益处。柠檬富含柠檬酸盐，这种成分能抑制草酸钙结晶的形成，从而降低肾结石风险。对于已形成的结石，适量饮用柠檬水也可能帮助减缓结石增大或促进排出。但具体效果因人而异，需结合个体情况判断。
柠檬水的保护作用主要源于其化学成分。柠檬酸盐能与尿液中钙离子结合，减少游离钙与草酸结合的机会，从而抑制常见草酸钙结石的形成。柠檬水可碱化尿液，创造不利于某些类型结石形成的环境。每日摄入约120ml纯柠檬汁稀释的饮品，可使尿液中柠檬酸盐浓度显著提升。但需注意，市售柠檬饮料可能含糖量过高，反而增加结石风险，建议使用新鲜柠檬制作。饮用时需保持充足水分，每日总饮水量应维持在2-2.5升，才能更好发挥稀释尿液的作用。
饮用柠檬水需注意浓度与饮用量。过量摄入可能导致牙齿珐琅质腐蚀，建议用吸管饮用并漱口。胃酸过多或胃溃疡患者应谨慎，柠檬酸可能刺激胃黏膜。糖尿病患者需控制添加糖分。肾结石类型多样，尿酸结石和胱氨酸结石对柠檬酸反应不同，需经尿液化验确认结石成分后针对性调整。合并肾功能不全者需限制液体摄入总量。任何饮食调整都应配合医生指导，严重结石仍需药物或手术治疗。柠檬水作为辅助手段，不能替代正规医疗方案。
