男性生殖系结核需结合临床表现、影像学检查、实验室检测、病理学诊断、治疗反应进行鉴别。具体分析如下：
1.临床表现：男性生殖系结核常见症状包括阴囊肿胀、疼痛、附睾硬结或窦道形成，部分伴有低热、盗汗等全身症状。病程进展缓慢，易与普通感染混淆，但结核性病变对抗生素治疗无效。
2.影像学检查：超声检查可显示附睾或睾丸内不均匀低回声区，伴钙化或脓肿形成。CT或MRI有助于发现泌尿系结核合并的病灶，如肾脏或输尿管病变，为鉴别提供依据。
3.实验室检测：结核菌素试验或γ-干扰素释放试验阳性提示结核感染可能。精液或脓液涂片抗酸染色检出结核分枝杆菌可确诊，但阳性率较低，需结合培养或分子检测提高检出率。
4.病理学诊断：组织活检可见典型干酪样坏死、朗格汉斯巨细胞等结核特征性改变。病理检查是确诊的金标准，尤其适用于与其他肉芽肿性疾病鉴别。
5.治疗反应：抗结核治疗有效是重要鉴别点。若疑似病例经规范抗结核治疗后症状缓解，病灶缩小，可支持结核诊断。
诊断过程中需综合考虑病史、体征及辅助检查结果，避免漏诊或误诊。抗结核药物需足量足疗程使用，定期评估疗效及药物不良反应。合并其他系统结核时应协同治疗，必要时手术干预。
