适量食用沙糖桔通常不会引起腹泻，但过量摄入可能导致消化不适甚至腹泻。沙糖桔含较多果糖和膳食纤维，部分人群肠道对果糖吸收能力有限，大量果糖在肠道积聚会升高渗透压，吸引水分进入肠腔，可能引发渗透性腹泻。沙糖桔中的有机酸可能刺激肠黏膜，加速肠道蠕动，尤其空腹食用时更易出现腹部不适。
沙糖桔的膳食纤维虽有助于促进肠道蠕动，但过量摄入会打破肠道菌群平衡。成年人每日膳食纤维推荐量为25-30克，而每100克沙糖桔约含1.4克纤维，若一次性进食过多，叠加其他饮食中的纤维，可能超过肠道耐受量。果糖不耐受人群更需注意，这类体质缺乏充分分解果糖的酶，未吸收的果糖在结肠发酵产气，可能伴随腹胀、腹泻。沙糖桔的酸性成分也可能刺激胃酸分泌，肠胃敏感者可能出现反酸或排便次数增多。
食用沙糖桔需控制单次摄入量，建议每日不超过10-15颗，儿童减半。避免空腹食用，可与坚果、燕麦等食物同食以延缓果糖吸收。肠胃功能较弱或已有腹泻症状时应暂停食用。注意观察排便变化，若持续腹泻需排查是否合并细菌感染或过敏。糖尿病患者更需警惕，沙糖桔含糖量约11%，过量可能影响血糖稳定。选择新鲜果实，霉变沙糖桔产生的展青霉素等毒素会直接损伤肠道黏膜，加剧腹泻风险。
