龙眼并不属于难消化的食物。龙眼果肉柔软多汁，含有丰富的果糖、维生素和矿物质，适量食用对大多数人而言消化负担较小。其膳食纤维含量适中，既不会因过高造成消化困难，也不会因过低影响肠道蠕动，属于较易吸收的水果之一。
龙眼的消化情况与食用量和个体体质密切相关。果肉中的天然糖分和水分能快速被人体吸收，但过量食用可能因摄入过多果糖导致腹胀或轻微腹泻，尤其对果糖不耐受人群更需谨慎。龙眼核坚硬不可食用，需注意避免误吞。龙眼干因水分减少，糖分浓缩，消化速度较鲜果稍慢，但适量食用仍属安全范围。消化功能较弱者可将鲜龙眼稍作咀嚼或选择龙眼干泡水饮用，以降低胃肠负担。中医认为龙眼性温，体质燥热者大量食用可能引发上火症状，间接影响消化功能。
食用龙眼时需注意控制单次摄入量，建议成人每日鲜果不超过15-20颗，龙眼干不超过10颗。空腹时大量进食可能刺激胃黏膜，最好餐后1小时食用。糖尿病患者应咨询医师，因龙眼升糖指数较高。幼儿及老人食用需去核并切小块，防止噎呛。若出现消化不良症状如胃胀、反酸，可暂停食用并观察。龙眼与海鲜同食可能加重部分人过敏风险，需留意食物搭配。储存不当的变质龙眼会产生发酵物质，务必选择新鲜无酸味的果实食用。
