睡久了就会头疼主要考虑以下两方面原因引起的：

第一，植物神经功能紊乱。当患者平时养成的作息时间被打乱，就会引起植物神经功能紊乱，导致头痛，头晕，恶心等症状，患者多能通过自身的调节，一般很快就会恢复。

第二，睡眠时间长出现头痛症状，可能伴有着凉感冒，一般是病毒感染引起的，就会出现头痛的症状，可能还会伴有鼻塞、流涕、咽痛，轻者可以通过多喝水，经过自身调节可以恢复，严重的可以口服抗病毒的药物，一般一周以内就会痊愈，不要过度的担心。