排便不干净的情况下，一般是不建议做肠镜检查的，因为这会带来很多不利的因素，会影响到检查结果。

首先，排便不干净的情况下，肠道内充满粪便，这时候结肠镜向肠道内进去的通路受阻，镜子进不去，所以检查就很难做。

再者，即使是粪便比较稀薄，镜子可以进去，但是也会严重地影响到结肠镜的观察视野，所以出现检查结果不清楚的情况就会变大。

还有，如果排便不干净，患者在进行结肠镜检查的时候，有可能会出现腹泻的情况发生，造成不必要的麻烦。