肛瘘出现很疼的症状说明肛瘘的外口封闭或瘘管堵塞，瘘管内的脓液及坏死组织不能流出导致瘘管感染加重，有的甚至是形成了新的肛周脓肿，所以患者会感到很疼痛。

当出现这种情况时要立即进行抗感染治疗，可口服或静脉滴注抗菌药物，如果出现发热、畏寒等全身症状，要及时到医院就诊，必要时还要行肛瘘切开挂线术或肛周脓肿根治术。

只有将感染完全控制住，患者的疼痛症状才会减轻。