腱鞘囊肿和腱鞘炎区别在于病情不同，腱鞘炎主要会出现在手腕上，而腱鞘囊肿则是在关节处长囊性肿物。

腱鞘囊肿属于实质性疾病，患有腱鞘囊肿的患者关节处，会有无色或者是黄色液体溅出来。而腱鞘炎属于一种炎性的反应，没有实质性病变。腱鞘炎一般是因为长时间使用同一个姿势而造成的，临床表现为局部疼痛。

而引起腱鞘囊肿的主要问题在于局部关节营养不良，所以更需要手术治疗，而腱鞘炎一般需要使用药物治疗，必要时再行手术治疗。