甲状腺囊肿在3cm以上的时候，建议要做手术治疗。

因为甲状腺囊肿是甲状腺的良性疾病，在包块比较小的时候，一般建议可以定期观察，通常半年复查一次甲状腺超声，暂时不需要做手术。另外，建议清淡饮食，少吃辛辣刺激的食物、少吃海产品等。在复查的过程当中，如果发现囊肿体积增大，比如直径超过3cm，包块明显，有压迫等症状的时候，就要建议手术。

另外，如果甲状腺囊肿短时间之内突然增大，伴有疼痛，内部可能会有出血或者感染等情况，也需要建议做手术。