先天性胫骨假关节的形成原因并不是特别清楚，是先天性发育异常引起发病。考虑可能原因有以下的几点：

第一个就是在宫内发育的过程中，受到了损伤和挤压，可能和母亲炎症反应，以及疾病有一定关系，包括服用一些药物。同时，有可能和遗传有一定的关系，包括先天性下肢缺如和先天性胫骨假关节都有一定的联系。

最后就是先天性胫骨假关节可以在损伤，或者其他的病毒感染以后引起，一般病因并不是特别地明确。所以，一旦发现以后，需要和早期的损伤进行鉴别。如果比较明显，同时进行一定的检查防止骨折并且进行及时的治疗。