1、血行播散。该并发症比较少见，一般是阿米巴原虫侵入肝内血管，经肝静脉回流至右心，并随血流播散到全身，而形成其他脏器的阿米巴病。

2，继发细菌感染。患者高热不退，中毒症状明显。最常见的细菌有大肠杆菌，金黄色葡萄球菌，产气荚膜杆菌，变形杆菌，厌氧菌等。一般做肝穿刺抽脓后做细菌培养可以明确。

3、脓肿穿破。脓肿穿破，穿入胸腔形成脓胸，穿入肺内形成肺脓肿，与支气管相通形成肝-胸膜-肺支气管瘘，同时也可以破入纵隔、心包、腹腔等部位。 4、其他。少部分患者脓肿压迫胆小管或肝组织出现黄疸。