蹲下来起来后腰部特别疼只是一种单纯的症状，可能是筋膜炎或韧带劳损，也可能是腰椎间盘突出引起的，需要进一步CT检查确诊。

如果存在着腰椎间盘突出，由于这种蹲起的动作可能加重椎间盘压迫局部的神经，导致水肿加重，从而引起腰部的疼痛，来确定椎间盘突出的具体程度。

平时应该避免不恰当的扭腰或者长时间的弯腰。多注意休息和保暖，睡硬板床。对于疼痛剧烈反复发作的，可以进行局部的针灸理疗，以缓解肌肉痉挛，改善血液循环。可以在专业医生的指导下口服腰痛宁胶囊、塞来昔布等药物进行治疗。适当腰椎的牵引，以增加椎间隙，减轻椎间盘的压迫症状，缓解神经根的水肿。如果这种情况反复的发作，保守治疗无效的，也可以考虑进行微创的手术治疗，效果也不错。