睡觉醒来以后，右边眼睛肿了的原因可以是多方面的原因导致，常见的原因有眼部炎症感染、蚊虫叮咬以及全身性疾病导致。

1.眼部炎症感染。常见的眼部炎症有结膜炎、角膜炎、麦粒肿等。这些疾病可以导致眼睛充血、肿胀、疼痛，严重的时候还会有异物感、流泪和背光等。所以炎症感染的时候会出现眼睛水肿。

2.蚊虫叮咬。当患者晚上睡觉的时候，如果不小心被蚊虫叮咬之后，就会出现眼睛红肿痒。实际上是一种过敏反应，如果是咬的右边眼睛，就会出现右边眼睛水肿。

3.全身性疾病。临床上常见的全身性疾病导致眼睛水肿有肝肾功能异常、心脏疾病、甲状腺机能亢进、贫血等，都会引起眼睛水肿。