肛门里面疼痛，考虑可能存在以下几方面原因：

首先，考虑患者是否存在肛窦炎。由于肛窦特殊解剖，肛窦窦口向上，排便时粪便刺激局部组织或者有少许粪便残留在组织内，就可能诱发肛窦炎，出现肛门里面肿胀、瘙痒、疼痛等症状。

其次，考虑患者是否存在痔疮病变。当患者处于病变急性期，病变部位瘙痒组织水肿，就会出现疼痛、肿胀、便血等表现。

最后，考虑患者是否存在肛周脓肿、肛瘘等感染性病变。受病变影响出现局部感染病灶，会导致患者出现局部疼痛，多伴随高热、寒战等症状，需要及早就医，确诊病情以后，再针对性治疗。