对于衣原体尿路感染，在男性当中容易引起衣原体性泌尿生殖系统感染，也就是一开始在泌尿系统当中，那么衣原体会上行，进入到前列腺、精囊、附睾、睾丸当中，从而引起生殖系统的感染，那么会造成精子质量下降，从而引起不孕不育。如果导致衣原体从男性尿道射精进入女性阴道会导致女性妇科疾病的产生，导致衣原体阴道炎、宫颈炎以及子宫附件输卵管炎和子宫内膜炎的产生，因此是不孕不育的感染源之一。