怀孕五个月腹部两侧疼痛，主要考虑是由于肠道功能受到影响所导致。

在怀孕五个月时，子宫增大明显，会压迫腹腔内的肠管向两侧移动。同时，由于孕激素水平的增高，肠道蠕动减慢，肠道的消化功能会受到影响，此时出现腹胀、便秘的情况明显增多，继而会出现腹痛的症状，这种症状通过适当休息，大多可以得到改善。

在此期间还需要注意进行饮食调整，配合适当活动，以减少胃肠道的负担。避免因孕期不适，对孕妇的生活，造成直接影响。