中医不是不能用益生菌，是对于人体的生理功能和病理机制，与西医是有很大差异。

益生菌是西医理论依据，西药用来补充人体内的有效菌群，调节胃肠功能改善腹痛、腹泻、消化不良等。而中医认为出现胃肠功能紊乱，是脾失健运、运化失常，影响了胃的消化功能有关系，应用健脾和胃的方法治疗，常用香砂六君子汤加减，效果也不错。

目前临床上大多应用，中西医结合方法，治疗常见病多发病，调节胃肠功能应用益生菌，结合中医的辨证论治，治疗效果会更好。