房颤本身没有严重的不良后果，但是房颤可以引起血栓栓塞性疾病的并发症。

因为房颤后可以造成心房的增大，或者心房增大后可以引起房颤，二者相互作用。心房肌收缩减弱，血流速度减慢，血流淤滞可以形成心房内的血栓，心房内的血栓脱落后随着血流堵塞到相应的器官，常见的如脑栓塞、肠系膜动脉栓塞、下肢动脉栓塞或者肺栓塞等等。

如果房颤患者合并有高血压病、缺血性脑血管病、心衰、高龄或者外周血管病等等因素，需要尽早的进行抗凝治疗，以预防血栓栓塞性疾病的发生。