乳腺纤维腺瘤和乳腺囊肿存在很多的区别，在发病年龄上，乳腺纤维腺瘤常见于年轻女性，最常见的年龄是15~35岁之间。乳腺囊肿可以见于任何年龄段女性。

组成部分上二者也有区别，乳腺纤维腺瘤是由于乳腺的小叶和间质，受到激素的刺激而产生的实性肿块。乳腺囊肿则是由于囊壁和囊内的液体所组成。

在临床触诊，乳腺纤维腺瘤一般可以触及到表面光滑活动度好的无痛性肿块。乳腺囊肿一般不容易触及，通常是经过彩超检查时发现，彩超下乳腺纤维腺瘤多表现低回声。而乳腺囊肿多表现为无回声。