膈下脓肿常用的检查方法有血培养、脓液培养、血常规、X线检查、B型超声检查、CT扫描，检查的时候可以发现白细胞计数增高。

X线检查可以看见患侧的膈肌抬高、活动受到限制，还可以看见膈下气液面以及胸腔积液。

B型超声检查的时候可以看见患侧膈下有液平段，这样有助于脓肿的诊断、准确定位，而且还可以在B超的引导下进行诊断性的穿刺，CT扫描能够准确的确定脓肿的部位、大小以及与周围组织的关系。