龟头上长水疱可以通过涂抹药膏进行治疗。龟头上长水疱，先明确引起水疱的病因。

如果珍珠疹引起的水疱，一般长在冠状沟附近，不会有明显的症状，不用特殊治疗，大多可自行缓解。如果是因为包皮龟头炎引起，先要保持龟头局部的清洁，用高锰酸钾溶液清洗龟头，将龟头内的细菌和包皮垢清洗干净。

明确是霉菌引起的水疱，可以涂抹抗霉菌的药物，比如克霉唑乳膏、氟康唑乳膏，必要时结合口服抗霉菌的药物治疗。尖锐湿疣引起的水疱，可通过做激光切除治疗。