三岁小孩睡觉起来脚疼痛，多数是生长痛引起，属于正常的生理现象。因为三岁的小孩子体格发育比较快，而且平时活动量较大，容易出现生长痛的现象，就会在睡觉起来的时候腿脚疼痛感比较明显。可以及时予以维生素D和钙剂的补充，同时注意避免剧烈活动，以免加重肌肉疲劳。

另外，有时孩子睡觉起来感觉脚疼，也可能是睡前玩耍导致韧带损伤所引起。这种情况属于异常的现象，需要及时观察是否有活动受限。必要时进行X线等相关检查，排除骨骼损伤的可能性，以便及时治疗。