肛瘘一般不会自愈，即使轻微的肛瘘也是如此。

肛瘘是一种肛门周围软组织的慢性、化脓性疾病，是由内溃口、外溃口及皮下瘘管三部分组成的，可以引起肛门肿痛、破溃、流液等症状，反复发作，迁延不愈。根据患者抵抗力、肛门卫生条件，以及生活和饮食习惯等不同，有的肛瘘频繁发作，而有的肛瘘数月甚至数年才发作一次。

根据临床表现的不同，肛瘘可以分为单纯性肛瘘和复杂性肛瘘，也可以分为低位肛瘘和高位肛瘘。但不管哪种类型的肛瘘，都不会自愈，手术是唯一可以治愈的治疗措施。