大拇指甲空了一截的具体原因，要依据局部的形态和实验室检查进行判断。

1.如果局部指甲形态正常，单纯只是空了一块，真菌检查为阴性，考虑为微量元素缺乏引发的甲损坏。这种情况主要是由于指甲在生长过程中，因为微量元素缺少而与甲床分离。

2.如果空了一截的大拇指甲表面有粗糙或轻度的破损，颜色轻度发黄或者发灰，而真菌检查呈现阳性。考虑为真菌感染之后引发的甲真菌病，也称之为灰指甲，是真菌代谢繁殖中破坏甲板下方的连接部位而形成的这种情况。