头颅的核磁共振检查是能够检查出脑积水的，而且目前核磁共振检查已经被公认为是诊断脑积水的一种可靠的影像学检查手段。它不但能够很好地明确脑积水的病因，而且能够对脑积水进行分类，并且能够与其他原因所导致的脑室扩大进行鉴别。

核磁共振检查通常比CT的优势更多一些，因为它可以直接进行三维成像，特别是对一些重要的部位，比如后颅凹，因为核磁共振的矢状面扫描能够更好地显示出中脑的导水管，而且不受颅骨或者是气腔所致的伪影的影响。

所以很多患者在怀疑脑积水的时候，一般医生都会为其首选核磁共振检查。