做肛瘘手术是不会出现疼痛。

因为做肛瘘手术之前必须要打麻醉药，麻醉药主要分为全身麻醉和局部麻醉。通常做肛瘘手术一般选择局部麻醉，在注入麻醉药的时候，会出现轻微的疼痛，麻醉药起效后，下半身会失去知觉，做手术也不会出现疼痛。

但是做手术之后，因为留下有切口，切口没有完全愈合之前是会出现疼痛。如果疼痛较为剧烈，可以短暂用止痛药物，手术后创伤面疼痛的时间大概持续7天左右，通过局部的中药坐浴、理疗和涂抹止痛药膏，这种疼痛逐渐减轻，甚至消失。