怀孕三个月阴道流血，通常是出现异常情况，比如先兆流产，与多种因素有关，比如心理因素，剧烈运动、饮食因素等。在确诊以后需要及时进行保胎治疗。

如果存在胎盘低置的情况，在怀孕三个月时也会出现阴道流血，也需要进行保胎治疗。如果胚胎已经停止发育，则立刻进行流产手术，防止出现大出血。宫颈息肉可能也会导致阴道出血，在确诊以后，可以将宫颈息肉切除，然后压迫止血。

因此，在怀孕三个月时出现阴道流血的情况后，千万不要忽视，要尽快到医院就医，进行检查和治疗。