长智齿旁边的肉会肿起来的原因包括：

1.智齿萌出时，前方的恒牙列已经完全建立，磨牙后区的空间不足，给智齿生长造成困难。智齿生长速度较为缓慢，牙龈表面隆起肿胀时间较长，产生疼痛。

2.智齿牙冠面积较大，远中部分软组织没有完全退缩，会与牙面形成盲袋嵌塞食物残渣和软垢。细菌毒力较强时，会引发牙龈肿胀。时间长了，纤维组织大量增生，产生质地较硬的龈瓣，容易反复破溃。

3.智齿方向倾斜，与前方邻牙形成狭窄间隙时，嵌塞食物纤维不易清除，会刺激软组织经常肿胀、疼痛。