牙齿最里边的牙包肉肿起来很可能是牙周炎或是智齿引起的牙龈肿痛，也可能是上火引起的牙龈发炎。

如果只是简单的牙龈发炎，可以吃一些消炎药物进行治疗，如甲硝唑片；如果是智齿引起的需要口服消炎类药物，同时可以涂抹一些碘甘油。

在治疗期间要注意养成好的生活习惯，尽量不要吃辛辣刺激的食物，避免上火引起病情加重。同时要避免油腻的食物摄入，多饮水。如果是智齿引起的牙包肉反复肿胀、发炎或者智齿位置不正，最好不要拔牙。