扁桃体发炎以后是否可以吃头孢克肟进行治疗，需要根据造成扁桃体发炎的原因来判断。

首先，如果导致扁桃体发炎的原因是鼻病毒，或者是腺病毒等病毒的感染，而且后续没有出现细菌感染的情况，一般是不可以吃头孢克肟来治疗的。因为头孢克肟属于抗生素类药物，并不具有抗病毒的功效。

但如果患者的扁桃体发炎是因为链球菌等细菌感染造成的，或者是在病毒感染后出现了化脓等细菌感染的并发症，就可以服用头孢克肟等抗生素类药物来治疗。患者在治疗的时候，要注意多喝水、清淡饮食。