α1抗胰蛋白酶缺乏性肝病的后遗症，主要的还是对于肝脏的损害。

因为它会导致肝细胞的纤维化，而影响到肝脏的功能，会使得肝脏的作用受到限制。所以会出现全身很多的症状，如进食量下降、代谢紊乱、肝肿大、脾脏肿大、上消化道出血等等。以及影响到其它的脏器而导致肺气肿、紫癜等异常的表现，严重的还有可能导致肝癌，有可能能危及到人的生命。

这种疾病属于代谢遗传基因异常引起的疾病，所以危害比较大。在治疗上也十分有限，很大程度上只是在缓解延长患者寿命。