一般情况下，巧克力囊肿在怀孕以后并不会消失，而且有些女性在怀孕以后，巧克力囊肿会出现缩小或者是增大的情况。

在怀孕期间，需要定期做B超监测巧克力囊肿生长速度。如果巧克力囊肿生长速度比较慢，或者是出现缩小情况，不需要进行手术治疗；如果巧克力囊肿生长速度比较快，必要时可以进行手术治疗。

巧克力囊肿大多数情况下，是由于子宫内膜异位症所导致的；如果是在备孕之前女性就存在巧克力囊肿情况，需要到医院进行检查；如果巧克力囊肿超过5cm以上，需要先做手术治疗。