肩胛骨缝疼的原因，多见于以下几种：

第一，可能是肩胛内侧滑囊炎，常在压痛的时候比较明显，需要活动肩部、颈部肌肉才能缓解疼痛。

第二，可能是肩胛骨处出现骨裂或者骨折，血肿和炎症因子刺激了痛觉神经，引起肩胛骨缝疼。

第三，可能是由于是肺部感染引起的炎症，或者胸膜炎，当胸廓进行运动的时候，会摩擦导致肩胛骨缝疼。

第四，可能是由于脏器病变引起背部肩胛骨缝处放射痛，例如胰腺炎、胆囊炎，多表现为牵拉痛。建议患者及时去医院就诊，明确具体的病因，以免延误病情。