肛周脓肿可以一次性根除，首先，需要采取手术治疗。其次，需要进行肛周脓肿一次性根治术，也就是在手术的过程中，将脓腔切开引流的同时，需要探查肛周脓肿的内口。也就是引发肛周脓肿的感染源，找到内口后将内口一并切开，就可以达到一次手术根治肛周脓肿的目的。

目前由于临床医生手术经验的积累，大多数的肛周脓肿均可以行一次性根治术。

但是对于一些位置非常高，脓腔走行复杂，内口探查困难的患者，也不必强行去探查内口，以免造成假性内口而导致术后复发。