先天性的肛门闭锁可以治愈，一旦确诊先天性肛门闭锁，应该尽早手术治疗。先天性的肛门闭锁是因为胚胎发育过程中受到基因突变的影响，辐射有毒、有害物质等不良因素的刺激导致肛管形成异常所引起。

根据闭锁的部位与会阴部位的皮肤的距离，分为高位肛门闭锁和低位肛门闭锁。低位肛门闭锁的一般治疗比较简单，只要将肛门部位的皮肤、皮下组织切开，达到上段的肛管盲端进行术中的扩肛，防止感染和粘连就可以。

高位肛门闭锁的手术难度比较大，有些患儿可能肠道肛管发育都有异常，这种情况先需要造瘘手术，然后待孩子的精神状况好转，再进行一些人工肛门的成型手术治疗。