肛周脓肿术后是否会发展成为肛瘘，主要是看肛周脓肿的手术方式。

如果患者单纯行肛周脓肿切开引流术，绝大多数会在术后形成肛瘘，并需要在三个月后行肛瘘根治性手术，才能完全治愈。而如果患者肛周脓肿的手术方式为一次性根治术，也就是患者在手术的过程中就明确了肛周脓肿的内口，在切开脓腔的同时将内口一并切开，在术后大多数的患者并不会发展成为肛瘘，但手术创伤相对偏大。

目前在临床上绝大多数的肛周脓肿患者，一般均行一次性根治术，主要为了避免二次手术。