两边肩胛骨疼痛可能是因为不良姿势造成损伤，肌肉长期不活动而出现僵硬、粘连等，出现渗出后刺激神经后造成两边肩胛骨疼痛。急性扭伤、外伤、打击伤等，也会造成肌肉有轻微撕裂，渗出刺激神经从而产生疼痛。

长期低头造成颈椎病，会放射至双侧肩胛骨。同时，骨质出现增生、疏松，骨强度、密度减低后出现退行性变等，不仅会产生酸痛，还会连带局部小关节韧带硬化，从而出现疼痛。

双侧肩胛骨疼痛还要注意，是不是一些内科疾病引起，比如肺炎、心肌缺血，或者反流性食道炎等，可能会造成局部牵涉痛和放射痛，需要对症检查清楚后进行治疗。