肠透视和肠镜的主要区别在于检查的方法不一样。肠透视一般使用的是腹部X线透视，只能够大体地判断肠道内是否有异常现象。

肠镜主要是通过医学仪器通过肛门进入到肠道，观察肠道内的情况，可以直接取组织活检或者是进行治疗。

肠透视和肠镜都是一种关于肠道疾病的检查手段，但是目前多会选择肠镜检查，这样可以更准确地判断出肠道内是否有异常现象出现，还可以直接取病变处的组织进行活检，甚至还可以直接对病变处的组织进行治疗。