睡觉时屁股两侧疼痛，考虑是腰椎间盘突出引起的坐骨神经痛。或者是臀部长时间受压引起，也就是仰卧位时间过长会导致屁股的两侧疼痛。

建议先观察3天，如果疼痛不缓解，可以到医院做一个腰椎的核磁共振检查，或者做一个双髋的核磁共振，看骶髂关节是否出现了问题。如果有骶髂关节的炎症，再结合人类白细胞抗原27阳性，这个时候要考虑是强直性脊柱炎。

但一般情况下，如果卧床休息3天症状可以得到缓解，也就是一般的局部的无菌性炎症，可以给予口服非甾体类的消炎药，局部理疗，对症治疗就可以了。