儿童膝盖窝疼的原因主要有以下几个方面：

1.生长痛导致的膝盖窝疼。特别是处于快速生长的儿童，有一定几率会导致生长痛的出现，这些疼痛的部位一般没有任何的外伤史，而且活动也正常，局部也没有红肿和压痛的症状。主要是因为活动量比较大，加上长骨生长比较快，和肌肉的筋腱生长发育不协调，就会导致生理性的疼痛。

2.缺钙也会引起膝盖窝疼痛。因为骨骼的发育基本原料来源于钙质，如果身体缺钙就会影响到骨骼的发育，导致骨骼出现异常，也会引起疼痛感。

3.外伤导致。如果孩子玩耍的时候磕碰到膝盖或者摔倒，都容易导致膝盖部位出现损伤而引起疼痛感。